La Ontología de Plantas es una única y efectiva herramienta para acercar a las comunidades que enfatizan sus investigaciones en diferentes disciplinas tales como la genética, biología molecular, biología celular, taxonomía, botánica y genómica.
Básicamente, estamos desarrollando un set de términos de vocabulario controlado que describen estructuras anatómicas y morfológicas y estados de desarrollo en angiospermas y en plantas no productoras de flores (gimnospermas, helechos y musgos). Estos términos son aplicados para anotar aspectos espaciales y temporales de la expresión de genes y los fenotipos observados en mutantes, variantes naturales y rasgos asociados cuantitativos de loci.
Las anotaciones se están llevando a cabo en colaboración con otras bases de datos de plantas participantes y bases de datos de grandes repositorios de secuencias moleculares y germoplasma. Estamos mapeando los términos ontológicos desarrollados en este proyecto en vocabularios similares ya desarrollados y utilizados en varios proyectos nacionales e internacionales para la anotación de los genomas de plantas y en la fenotipificación de germoplasma.
La Ontología de Plantas (PO) desarrollada en este proyecto servirá de punto de referencia común, permitiendo análisis comparativos de todas las bases de datos mencionadas. Adicionalmente, cada término está siendo ilustrado, y la Dra. Gandolfo y su grupo están trabajando en el fotografiado de cientos de preparaciones anatómicas y embriológicas que son parte de la colección de Anatomía Vegetal de Cornell University (CUPAC) que representan los términos ontológicos. Las fotografías podrán ser accedidas a través de Plantsystematics.org y de PO. Aunque los términos ontológicos están en inglés, estamos desarrollando versiones en español y japonés.
Este proyecto está subvencionado a través de un subsidio de la National Science Foundation 0822201.
Noticias sobre Ontologia de Plantas
This will have the 10-21-11 PO news first part... maybe.